Muzea mogą mieć w pewnym stopniu odrębne jednostki, wydzielone muzea. W systemie Muzeo są to oddziały:
W danych oddziału należy mu przypisać kooperanta z bazy, gdzie są zawarte dane adresowe:
Jeżeli oddział ma odrębny dziennik korespondencji, to należy wprowadzić formułę na wyznaczanie numerów i znaków dokumentów w dziennikku. W zakładce grafiki można podać odrębne grafiki nagłówków i stopek dla drukowanych faktur i innych dokumentów.
Zapisy w bazie kooperantów będących oddziałami są kolorowane na zielono.
Należy w danych kooperanta - oddziału wprowadzić wskazanie na siedzibę główną. W opcji Popraw i po wybraniu Szczegóły trzeba wybrać koopernta będącego siedzibą główną muzeum.